2009년 8월 11일 화요일

VHGDP-CEPH Human Genome Diversity Cell Line Panel

VHGDP-CEPH Human Genome Diversity Cell Line Panel

51개 민족, 1050 명, 1063 임파섬유아세포주 (lymphoblastoid cell line, LCL), 밀리그램양의 DNA이 쟝도세박사 재단에 기탁.

Human Genome Diversity Project (HGDP), CEPH에 의해 여러 실험실로부터 LCL이 수집: 서열다양성, 현대인류집단의 역사에 대한 연구를 위한 제한없는 DNA제공을 위함. 성별, 민족, 국가지리정보에 제한됨.

지금까지 650K SNP, 853 microsatellite 밝혀짐.

이 정보들을 제공하는 디비가 HGDP-CEPH HUMAN GENOME DIVERSITY PANEL DATABASE WEB VERSION 2.0 이고 최신버전.

패널은 13쌍의 duplicate LCL을 가짐. 이는 2개의 유전적으로 비전형적인 개인으로부터 온 것임.

서플1은 일루비나 650K로 찍은 지노타입 플랫파일
서플2는 일루미나 550K로 찍은 플랫 파일 데이터

데이터기탁자가 공개시일 제한하지 않으면, 디비를 통해 계속 공개, 제한을 원하면 6개월뒤에 종료됨.