2008년 10월 3일 금요일

PLINK

PLINK

1. ped파일은 6개의 정보컬럼 및 지노타입 데이터 컬럼으로 구성된다.

FamilyID IndivisualID PaternalID MateralID Sex Affected Genotypes

이때, 정보컬럼의 각 공백은 스페이스 혹은 탭
지노타입데이터는 1개 이상들어가는데, 형태는 다음과 같다.

A A
? ?
N N

두개의 allele 사이는 스페이스로 구분.
각 각 SNP 간의 사이는 스페이스 혹은 탭으로 구분.

댓글 없음: